Номенклатура нуклеозидов и нуклеотидов

Положение фосфатной группы в молекуле нуклеотида указывается цифрой. Например, аденозин с фосфатной группой, присоединенной сложноэфирной связью к 3-му атому углерода рибозы, обозначается как 3¢-монофосфат. Штрих после цифры ставят для того, чтобы отличать номер углерода в пуриновом или пиримидиновом основании от положения атома углерода в углеводном остатке. При нумерации атомов углерода в азотистых основаниях штрих не ставится. Нуклеотид, состоящий из 2¢-дезоксиаденозина (dAdo) с фосфатным остатком по С5 атому в молекуле сахара обозначается как 2¢-дезоксиаденозин-5^¢-монофосфат.

Нуклеозиды, содержащие аденин, гуанин, цитозин, тимин и урацил, принято обозначать буквами A, G, C, T, U или общепринятыми аббревиатурами Ado (dAdo), Guo (dGuo), Cyd (dCyd), Thd, Urd, соответственно.

Таблица 12.1 – Номенклатура нуклеозидов и нуклеотидов риборяда

В таблице приведены примеры только рибонуклеозидов и рибонуклеотидов. Наличие символа «d» перед соответствующей аббревиатурой нуклеозида или нуклеотида означает, что углеводным компонентом данного компонента нуклеиновых кислот является 2¢-дезоксирибоза. Например, гуанозин, содержащий 2¢-дезоксирибозу, обозначается как dG (dGuo, дезоксигуанозин), а соответствующий ему монофосфат с фосфатной группой, присоединенной к пятому атому углерода дезоксирибозы, – 2¢-дезоксигуанозин-5¢-монофосфат (dGMP). Часто, в тех случаях, когда фосфат присоединен к С5 атому рибозы или 2¢-дезоксирибозы, символ «5¢» опускается. Так, гуанозин 5¢-монофосфат принято обозначать GMP, а 5¢-монофосфат дезоксигуанозина сокращают как dGMP. Если к углеводному остатку нуклеозида присоединены 2 или 3 остатка фосфорной кислоты, используются аббревиатуры DP (дифосфат) и TP (трифосфат). Таким образом, аденозин с тремя фосфатными группами в 5¢-положении углевода будет обозначаться как АТР. Примеры моно-, ди-, и трифосфатов Ado и Urd приведены на Рис. 12. 6.

Рисунок 12.6 – Структурные формулы моно-, ди-, и трифосфатов аденозина и уридина

Структура и информационные свойства нуклеиновых кислот