Роль мобильных генетических элементов

Регуляция экспрессии генов у прокариот и эукариот

Ф. Жакоб и ж. Моно 1961: общая теория регуляции генов.

· Сущность теории сводится к «выключению» или «включению» генов как функционирующих единиц, к возможности или невозможности проявления их способности передавать информацию о структуре белка.

· У прокариот гены, контролирующие синтез белков-ферментов, катализирующих ход последовательных биохимических реакций, объединяются в структурно-функциональную единицу – оперон.

Виды оперонов

· Индуцибельный – регулятором является исходный продукт (субстрат). Субстрат стимулирует реакции своего метаболизма.

· Репрессибельный - регулятором является конечный продукт (корепрессор). Он тормозит реакции, ведущие к его образованию.

Состав индуцибельного оперона

· Структурные гены, кодирующие белки-ферменты

· Промотор – участок молекулы ДНК, к которому присоединяется РНК-полимераза

· Оператор – участок молекулы ДНК, место связывания с регуляторным белком-репрессором

· Индуктор – метаболит, который связывается с белком-репрессором и переводит его в неактивную форму.Индуктор – метаболит, который связывается с белком-репрессором и переводит его в неактивную форму.

Синтез белка-репрессора контролируется геном-регулятором. Белок-репрессор обладает сродством и к оператору, и к метаболиту.

Принцип регуляции активности оперона заключается в следующем: сродство белка-репрессора с геном-оператором определяется наличием или отсутствием в клетке метаболита той цепи реакции, ферменты которой кодируются данным опероном.

Лактозный оперон E.coli

Регуляция экспрессии генов у эукариот

В основу регуляции генной активности у эукариот положено взаимодействие определенных участков ДНК с белками, которые называются транскрипционными факторами.

В разных клетках многоклеточного организма содержатся одинаковые гены, но экспрессируются они с разной скоростью и в разное время. В качестве регуляторных белков могут выступать как белки-репрессоры, так и белки-активаторы.

Регуляция экспрессии генов происходит на всех этапах реализации генетической информации в клетках.

Регуляция на уровне транскрипции:

1. Белки-факторы транскрипции (TF: IIA, IIB, IID, IIEиIIF) связываются с ТАТА блоком в области промотора

2. Энхансеры – усилители транскрипции

3. Сайленсеры – ослабляют транскрипцию

4. Структура хроматина.

На активацию влияетремоделированиегистоновых белков, которые участвуют в компактизации молекулы ДНК.

Метилирование участков ДНК (обычно по парам цитозин-гуанин) тормозит транскрипцию

5. Гормональная регуляция

· Стероидные гормоны связываются с белком-рецептором в клетке, данный комплекс проникает в ядро, связывается с определенными участками ДНК, регулируя транскрипцию.

· Пептидные гормоны связываются с белками-рецепторами на мембране и передают сигнал внутрь клетки на белки цитоплазмы, в ответ на внутриклеточные изменения в ядро поступает сигнал, регулирующий экспрессию.

Регуляция на уровне процессинга:

1. За точность процессинга отвечают малые ядерные РНК (мя-РНК), которые обеспечивают точную работу ферментов-рестриктаз.

2. Возможность альтернативного сплайсинга позволяет синтезировать различные матричные последовательности, а следовательно несколько полипептидов или разных РНК на базе одного гена.
альтернативный сплайсинг – процесс, позволяющий одному гену производить несколько мРНК и, соответственно, белков.

На уровне трансляции:

1. Исключается возможность использования и-РНК в качестве матрицы для синтеза белка в случае их несоответствия

2. Дифференциальная активность А-А-тРНКсинтетаз

3. Влияние гормонов

На уровне посттрансляционной модификации белка.

Изменение конформации белков – важнейший способ изменения их биологической активности!
Обеспечение правильного фолдинга и рефолдинга принадлежит белкам-шаперонам.

· проинсулин

Организация генома прокариот и эукариот

Генетический аппарат клетки

· Геном – генетический материал ядра в гаплоидном наборе хромосом

· Геном – суммарная длина ДНК в гаплоидном наборе хромосом.

Функциональная единица генома – ген.

Термин «геном» – Г. Винклер

· Плазмон – генетический материал цитоплазмы. Функциональная единица – плазмоген.

Размеры генома

· Мелких ДНК-содержащих вирусов и в центриолях 0,4-1 мкм (1200-3000 пар нуклеотидов)

· Геном пластид и митохондрий – 5-100 мкм (15000-300000 п.н.)

· Бактерий – 1000-2000 мкм (3-6 млн п.н.)

· E.coil– 1200 мкн (1,2 мм)

· Геном человека – 1990 создана Международная организация по изучению генома человека – 3,2 млрд. п.н.; 187 см

Геном прокариот

1. Объем генома E.coil – 1200 мкн (1,2 мм)

2. Информативная емкость генома – 2000-4000 генов

3. Нет дуплицирующихся генов

4. Классы генов по генопродуктам:

· Структурные – кодируют белки

· Регуляторные – кодируют белки-репрессоры

· Гены т-РНК – кодируют молекулы т-РНК

· Гены р-РНК – кодируют молекулы р-РНК

Геном эукариот

1. Суммарная длина молекулы ДНК человека – 187 см

2. Классы генов по генопродуктам:

· Структурные – кодируют белки

· Регуляторные – кодируют белки-репрессоры

· Гены т-РНК – кодируют молекулы т-РНК

· Гены р-РНК – кодируют молекулы р-РНК

· Гены гистоновые – кодируют гистоновые белки

3. Информативная емкость генома – 30-35 тысяч генов (у человека)

4. Избыточность ДНК в геноме – наличие дуплицирующихся генов

По числу повторов:

· Уникальные – до 10 повторов на геном (структурные гены)

· Умеренно повторяющиеся – 10^2 – 10^5 на геном (регуляторные, гистоновые, гены т-РНК, гены р-РНК)

· Многократно повторяющиеся – более 10^5 на геном.

В организации генома эукариот заложен принцип чередования уникальных и повторяющихся последовательностей (интерсперсия)

Повторяющаяся ДНК

· Тандемные повторы – расположены друг за другом («голова к хвосту»). У дрозофилы – повторяющиеся единицы в 5-7 п.н. (ААТАТ), (ААТАG), (AATATC) и др.

1. Центромерная ДНК (альфоидная) – повторяющиеся единицы длиной в 170 п.н. У человека – длина 250 т.п.н. - до 5 млн.п.н. В геноме 3%

2. Теломерная ДНК – GGGTTA, повторяются 250-1500 раз

3. Рибосомная ДНК

· Диспергированные повторы – разбросаны по всему геному: LINEи SINE–МГЭ

Роль мобильных генетических элементов

· Вызывают мутации генов

· Формируют хромосомные перестройки

· Изменяют активность и функции генов

· Достраивание хромосом после редупликации (дрозофилы)

· Используют для трансформации генов, клонировании генов.

ДНК митохондрий

· Секвенирована 1981 г.

· Кольцевая молекула, 16569 п.н.

· Содержит 37 генов: кодируют 13 белков, 22 молекулы т-РНК, 2 молекулы р-РНК

· Не содержат интронов

· Признаки наследуются по материнской линии и не являются менделирующими.

· Чувствительна к активным формам кислорода

· Имеет высокую скорость мутирования

· Мутации митохондриальных генов могут быть причиной наследственных заболеваний, процессов старения и развития возрастной патологии

· Определение нуклеотидной последовательности мит-ДНК позволяет установить эволюционное родство живых организмов.